公元2157年，人类舰队在深空遭遇未知敌人，唯一能与超级AI战舰“XL司令”进行脑波同步的飞行员陆航，在战斗中失忆。他醒来后只记得自己的代号“XL”，却要承担指挥全舰、拯救地球的使命。随着任务推进，陆航逐渐发现“XL司令”不是机器，而是他死去哥哥的意识上传体。第一季围绕他找回记忆、与哥哥AI和解、带领舰队突破包围圈展开，兼具硬核科幻与兄弟温情。
陆航在最终决战前触碰XL司令的核心，看见全部记忆——哥哥为了保护他自愿上传意识，成为战舰的“心脏”，他含泪启动超光速引擎，与哥哥并肩作战。
敌方母舰突然跃迁至地球轨道，XL司令自动激活防御协议，陆航被迫紧急升空，在炮火中完成第一次超机动，成功护住空间站。
陆航与XL司令的同步率达到100%，他能感知战舰每一个零件，甚至能听到哥哥的呼吸声，战舰化身人形机甲，一拳击碎陨石，全舰欢呼。
舰上部分机械兵被敌方病毒控制，陆航必须用XL司令的防火墙隔离，他在虚拟空间中与病毒对弈，最终用哥哥留下的密码成功杀毒。
舰队接收一段来自深空的重复信号，破译后竟是哥哥留下的语音“小航，别怕，哥在”，陆航第一次在驾驶舱里嚎啕大哭。
陆航在医院醒来，记忆停留在飞船爆炸前，XL司令通过广播说出他的真名“陆航，欢迎回来”，他看着舷窗外的星辰，决定接受使命。